Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm5710-201ENSMUST00000183020 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gzmb-201ENSMUST00000015581 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Cd1d2-203ENSMUST00000194208 1527 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm34105-201ENSMUST00000214812 571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Depdc1b-205ENSMUST00000171178 1404 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 4933436P19Rik-201ENSMUST00000217736 1442 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm12188-201ENSMUST00000117387 310 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm12338-201ENSMUST00000122170 192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Cnih3-203ENSMUST00000162685 602 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm27395-201ENSMUST00000183938 460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Nr1h4-202ENSMUST00000105296 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Calcoco2-201ENSMUST00000068686 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm12376-201ENSMUST00000120538 607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm23820-201ENSMUST00000158450 300 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm37559-201ENSMUST00000193556 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm42915-201ENSMUST00000197478 323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 AC154264.2-201ENSMUST00000216569 403 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 CT030664.1-201ENSMUST00000223639 908 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Tcl1b4-201ENSMUST00000000718 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm19173-201ENSMUST00000204494 1523 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Zfp819-202ENSMUST00000116324 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt1P13864 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms