Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cdc6-201ENSMUST00000092706 4614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TtrP07309 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms