Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms