Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm5266-201ENSMUST00000187302 1162 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Kctd19-201ENSMUST00000063071 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 AC123731.1-201ENSMUST00000227417 1403 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Fancb-203ENSMUST00000167446 2953 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Pvr-201ENSMUST00000043517 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Smim18J3QNP2 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Smim18J3QNP2 Cflar-201ENSMUST00000069333 3163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Smim18J3QNP2 Trim17-202ENSMUST00000075141 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Smim18J3QNP2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Smim18J3QNP2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Smim18J3QNP2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Nell2-201ENSMUST00000075275 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Sfmbt1-202ENSMUST00000112184 2936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Olfr173-202ENSMUST00000206205 2778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Rexo5-203ENSMUST00000106520 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 B3gat1-205ENSMUST00000161115 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Ankrd6-205ENSMUST00000108166 2321 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm42765-202ENSMUST00000200017 3131 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Krt222-201ENSMUST00000038214 2042 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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