Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ophn1-202ENSMUST00000113826 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Cald1-203ENSMUST00000115021 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Stk36-202ENSMUST00000087186 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ano1-203ENSMUST00000121758 4552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Pwp1-201ENSMUST00000001836 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm8005F6YKY3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms