Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176 ms