Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprfA2A8L5 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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