Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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