Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28036V9GXJ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms