Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vstm4T1NXB5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vstm4T1NXB5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms