Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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Krt27Q9Z320 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Krt27Q9Z320 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Krt27Q9Z320 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Krt27Q9Z320 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Krt27Q9Z320 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms