Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer1Q9Z2Y3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms