Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk1bQ9Z2C6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms