Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6ka4Q9Z2B9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6ka4Q9Z2B9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6ka4Q9Z2B9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6ka4Q9Z2B9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps6ka4Q9Z2B9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms