Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W8

Atp12a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp12aQ9Z1W8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp12aQ9Z1W8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp12aQ9Z1W8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms