Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx39bQ9Z1N5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms