Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.7 ms