Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Znf394Q9Z1D9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Znf394Q9Z1D9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf394Q9Z1D9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
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Znf394Q9Z1D9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Znf394Q9Z1D9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Znf394Q9Z1D9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Znf394Q9Z1D9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Znf394Q9Z1D9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Znf394Q9Z1D9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Znf394Q9Z1D9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Znf394Q9Z1D9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Znf394Q9Z1D9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Znf394Q9Z1D9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Znf394Q9Z1D9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Znf394Q9Z1D9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf394Q9Z1D9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Znf394Q9Z1D9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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