Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Padi1Q9Z185 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Padi1Q9Z185 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms