Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sumo3Q9Z172 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms