Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema4fQ9Z123 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema4fQ9Z123 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms