Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ccl8Q9Z121 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ccl8Q9Z121 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ccl8Q9Z121 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl8Q9Z121 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms