Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1312.3 ms