Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn1Q9Z0I7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms