Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap4s1Q9WVL1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap4s1Q9WVL1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms