Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Msl3Q9WVG9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msl3Q9WVG9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Msl3Q9WVG9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msl3Q9WVG9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msl3Q9WVG9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msl3Q9WVG9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msl3Q9WVG9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msl3Q9WVG9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msl3Q9WVG9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msl3Q9WVG9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms