Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Slit3Q9WVB4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slit3Q9WVB4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms