Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp4Q9WV89 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp4Q9WV89 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stxbp4Q9WV89 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp4Q9WV89 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp4Q9WV89 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp4Q9WV89 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp4Q9WV89 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp4Q9WV89 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp4Q9WV89 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp4Q9WV89 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp4Q9WV89 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp4Q9WV89 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms