Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx1Q9WV80 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms