Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms