Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Taf7Q9R1C0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf7Q9R1C0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms