Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0P4

Smap, Small acidic protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmapQ9R0P4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmapQ9R0P4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmapQ9R0P4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms