Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsjQ9R014 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsjQ9R014 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms