Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf4Q9QZS2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf4Q9QZS2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms