Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ripk3Q9QZL0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms