Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ercc4Q9QZD4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms