Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vps29Q9QZ88 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps29Q9QZ88 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms