Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmeff2Q9QYM9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmeff2Q9QYM9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmeff2Q9QYM9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmeff2Q9QYM9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmeff2Q9QYM9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmeff2Q9QYM9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmeff2Q9QYM9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmeff2Q9QYM9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmeff2Q9QYM9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmeff2Q9QYM9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmeff2Q9QYM9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms