Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp1Q9QY53 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms