Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms