Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip3Q9QXT8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms