Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Homer2Q9QWW1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer2Q9QWW1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms