Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc4Q9QUQ5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms