Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slamf1Q9QUM4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slamf1Q9QUM4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slamf1Q9QUM4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slamf1Q9QUM4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slamf1Q9QUM4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms