Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhoaQ9QUI0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhoaQ9QUI0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms