Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH7

Neu3, Sialidase-3, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu3Q9JMH7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neu3Q9JMH7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neu3Q9JMH7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms