Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LitafQ9JLJ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LitafQ9JLJ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms