Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2l2Q9JLG4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms