Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr5Q9JLF7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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