Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TefQ9JLC6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TefQ9JLC6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TefQ9JLC6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TefQ9JLC6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TefQ9JLC6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TefQ9JLC6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TefQ9JLC6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms